Установу створено у 1992 році. В 1995 році зареєстровано Інститутом ООН з проблем роззброєння (Женева) – UNIDIR (RN I-900).
Основний профіль діяльності – дослідження у галузі міжнародної політики, безпеки, оборони, політичного і соціального розвитку України, шляхів її інтеграції у європейське і світове співтовариство.
Протягом 1994-2008 років ЦМЗПУ досліджував низку питань у сфері взаємин Україна – ЄС, результатом чого стала поява аналітичних доповідей та інформаційно-аналітичних видань українською та англійською мовами, зокрема: Україна: проблеми міжнародних міграцій; Шлях України до ЄС: погляд з України; Відносини у трикутнику Росія-Білорусь-Україна.
Особливу увагу ЦМКЗПУ приділяє вивченню та дослідженню візової політики між Україною та державами – членами ЄС. Серію досліджень з візової практики країн ЄС було започатковано з метою компенсувати нестачу інформаційно-аналітичних матеріалів щодо візової політики ЄС та політики в сфері кордонів і міграції. В рамках візової тематики проведено більше десятка міжнародних проектів, опубліковано 5 інформаційно-аналітичних видань та численну кількість статей, зокрема з питань візових режимів, кордонів, міграції тощо.
З 2008 по 2009 роки ЦМКЗПУ здійснював координування роботою консорціуму неурядових організацій та аналітичних центрів України з досліджень візової політики України та держав-членів ЄС.
Результати досліджень ЦМКЗПУ доводяться до органів влади, включаючи Верховну Раду України, Секретаріат президента України, Раду національної безпеки і оборони України, Міністерство закордонних справ, до політичних лідерів в Україні та за кордоном.
