Регіональний філіал Національного інституту стратегічних досліджень в м. Ужгороді створений в 1999 році як структура, яка забезпечує інформаційно-аналітичну діяльність вищого керівництва держави, органів державної влади та місцевого самоврядування. Це - єдина фахова експертно-аналітична установа в регіоні, яка здійснює постійний моніторинг процесів розширення ЄС на Схід та сприяє мінімізації негативного впливу Шенгену на прикордонній території України.
Активізуючи громадськість регіону щодо практичної реалізації стратегічного курсу України на європейську інтеграцію, вирішення питань розвитку краю, філіал ініціює експертні обговорення та реалізує проекти з цих питань разом з експертними колами країн-сусідів України – нових членів ЄС. Це дає змогу виробляти консолідовану позицію регіональних експертних еліт прикордонних територій країн-сусідів, що дозволяє мінімізувати виклики та ризики, які несе трансформаційний процес. Філіал бере участь у розробці стратегії та програм розвитку Карпатського Єврорегіону (прикордонних територій України, Угорщини, Польщі, Словаччини та Румунії).
Філіал постійно підтримує партнерські відносини з відомими фондами та експертними центрами України та країн-сусідів. Серед яких: Словацька асоціація зовнішньої політики, Фонд Freedom House, Фонд ім. Фрідріха Еберта, Фонд Конрада Аденауера, Фонд Карпатського Єврорегіону, Карпатський фонд, Інститут євроатлантичного співробітництва, Український центр економічних і політичних досліджень ім. О. Разумкова, Міжнародний центр перспективних досліджень, Центр миру, конверсії і зовнішньої політики, Інститут проблем міжнародної безпеки РНБО України, Інститут оборони ім. Міклоша Зріні (Угорщина, Будапешт) та ін.
У співпраці з вищезгаданими установами, філіалом здійснено видання близько 20 – ти експертних публікацій на дану тематику, які передані виробникам зовнішньої політики України
